Né à Villefranche-sur-Saône en 1621.
Orphelin très jeune, il est envoyé à Paris où il apprend les langues latine et grecque.

Nommé aide-apothicaire puis apothicaire du duc Gaston d'Orléans.
Dès 1655, il entre au service de Philippe d'Orléans, alors duc d'Anjou en tant qu'aide-apothicaire, avec traitement de 600 livres ; il est également apothicaire par semestre des écuries de ce prince.

Nommé académicien chimiste de l'Académie royale des sciences à sa création en 1666.
Il travaille ensuite en 1670 et 1671 avec Samuel Cottereau Du Clos, dit Duclos, à l'étude des eaux minérales. Claude Bourdelin accomplit également une étude considérable sur les plantes.
Nommé pensionnaire chimiste le 28 janvier 1699, notons qu'il est le premier titulaire nommé par Louis XIV.

Mort à Paris le 14 octobre 1699.

Son éloge est prononcé par Fontenelle en 1699 (premier éloge prononcé à l'Académie royale des sciences).

· Académie des sciences, Index biographique de l'Académie des sciences 1666-1978, Paris, Gauthier-Villars, 1979.
· Bouvet (Maurice), « Les apothicaires royaux, chapitre 5 : Les apothicaires des princes », Revue d'histoire de la pharmacie, 19e année, Paris, 1931, n° 73, p. 75-95.